DISEÑO DE OLIGONUCLEÓTIDOS (Taller resuelto)

Taller resuelto sobre el DISEÑO DE OLIGONUCLEÓTIDOS


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Lista de preguntas con sus respectivas respuestas:

1. ¿Cuál es la especificidad (el gen que identifica) de los primers?

2. ¿Cuál es la Tm de cada uno de los primers?

3. ¿Cuál es el porcentaje (%) GC de cada uno de los primers?

4. ¿Cuál es el tamaño del producto identificado por estos primers?

5. ¿Cuáles otras especificidades identificarían estos primers si se utilizaran condiciones de baja

astringencia?

6. ¿Cuál es el símbolo oficial del gen?

7. ¿Cuál es la longitud del gen?7. ¿Cuál es la longitud del gen?

8. ¿Cuál es la ubicación cromosómica del gen?

9. ¿En cuál cadena del ADN se encuentra ubicado?

10. ¿Cuántos exones contiene éste gen?, ¿Entre que nucleótidos se encuentran cada uno de los

exones?

11. Descargue la secuencia de nucleótidos genómica de referencia en formato FASTA del gen que codifica para la insulina a partir del RefSeqs maintained independently of Annotated Genomes del NCBI.

12. Diseñe tres posibles juegos de primers utilizando la herramienta bioinformática Primer-BLAST para la secuencia de nucleótidos comprendida entre los 351 y 1050pb

13. Sobre la secuencia de nucleótidos entre los 351 y 770 pb identifique la posición de los primers:
ORF1F 5’-TGTGCGGGGAACGAGGCTTC-3’
ORF2R 5’-GGAGAAATGGGCTGCGGGGC-3’
Longitud del fragmento identificado: 359